Se doctoró en 1909 en la Universidad de Gotinga con la tesis Ministerialität in Südostdeutschland vom zehnten bis zum dreizehnten Jahrhundert ("La ministerialidad en el sureste de Alemania desde el siglo X al XIII") y completó su habilitación en 1913 en la Universidad de Münster.
En 1925 recibió una außerplanmäßige Professur ("cátedra adjunta") en la Universidad Tecnológica de Gdansk (ciudad entonces llamada Danzig), en 1927 fue destinado a la Universidad de Viena y, finalmente, a partir de 1930 trabajó como Ordinarius ("profesor titular") en la Universidad de Tubinga.
Kluckhohn se ocupó principalmente del Romantik (Romanticismo alemán) y de la Goethezeit ("era de Goethe").
Se definía como national ("nacional"), pero mantuvo una cierta distancia del Nationalsozialismus (nacionalsocialismo).
De 1946 a 1955 fue el primer presidente de la recién fundada Hölderlin-Gesellschaft (Sociedad Hölderlin).