La primera sede administrativa del partido se encontraba en la Estancia San Agustín, en el paraje de Gorchs (Partido de General Belgrano), ya que el pueblo de Las Flores aún no había sido fundado.

Aunque en el lugar ya existían algunas casas anteriores al poblado, el progreso edilicio fue lento, pero esto no impidió que antes de 1860 ya existieran en el lugar un templo católico, una comisaría y una escuela.

Como en tantos otros pueblos, la llegada del ferrocarril en 1872 significó un renovado impulso a la localidad.

Muchos mitos y leyendas bonaerenses rodean la zona de Las Flores.

Durante el siglo XIX, se contaba que en el área aparecía el alma en pena de un gaucho de apellido López, que pedía diezmo a quienes llegaban al pueblo o a quienes pasaban por ahí.