Entre estas se encuentran especies catalogadas a nivel nacional en riesgo de extinción.

Según la geomorfología el Parque se puede dividir en dos zonas bien definidas; una plana con un área de 34.000 ha, y una montañosa con 38.000 ha aproximadamente.

Sobresalen algunos promontorios menores, como la loma de Las Pulgas, con alturas inferiores a 15 metros.

Forma parte de la Serranía del Darién, con alturas mayores hacia la frontera.

En la actualidad el parque Nacional Natural Los Katios se encuentra rodeado por comunidades afrocolombianas, campesinas e indígenas.

En el mismo sector un poco más al sur se encuentra la comunidad campesina de Lomas Aisladas, conocida también como “El 40”.

En el sector norte se encuentra el resguardo indígena Arquia de la etnia Tule; en el sector nororiental sobre la margen izquierda del río Atrato se ubica la comunidad de Tumaradó perteneciente al Consejo Comunitario Mayor del Bajo Atrato.