El parque nacional se extiende desde la frontera marítima entre Alemania y Dinamarca en el norte hacia abajo hasta el estuario del Elba en el sur.

En la zona frisia septentrional, incluye las llanuras de marea alrededor de las islas Frisias septentrionales y las Hallig (islas sin diques).

El elemento terrestre está formado principalmente por marismas de agua salobre.

El punto central se encuentra en 53°59′56″N 8°16′2″E / 53.99889, 8.26722 Los límites externos se encuentran en 54°29′5″N 8°33′15″E / 54.48472, 8.55417 y 55°6′16″N 9°1′1″E / 55.10444, 9.01694 Tiene una altitud que va desde los 15 metros bajo el nivel del mar hasta los 5,5 metros por encima del nivel del mar.

Toda la región está habitada, habiendo más localidades en la zona de transición y menos en la zona núcleo.