[1]​En la temporada 1998-99, hizo su debut profesional con el Napoli de su ciudad natal cuando tenía 17 años.

[2]​La temporada siguiente fue fichado por el Parma, jugando junto a su hermano en su primera campaña en el club.

En julio de 2006, Cannavaro fichó por el Napoli y firmó un contrato por cinco temporadas.

[6]​En la temporada 2013-2014, con la llegada de Rafa Benítez al banquillo, su titularidad se fue reduciendo progresivamente.

Ha confesado en una entrevista que tiene dos "amores futbolísticos", el SSC Napoli y el Parma FC.