Sin embargo, la asociación indonesia de fútbol PSSI no descendió a los tres equipos de la provincia de Yogyakarta, incluido el PSS, aunque perdieron los partidos restantes debido al impacto del terremoto en sus instalaciones y vidas personales.

[1]​[2]​ El PSS abandonó la máxima categoría del fútbol indonesio en 2008 por cuestiones administrativas.

El club no pudo adaptarse rápidamente al cambio hacia el fútbol profesional con el lanzamiento de la Superliga de Indonesia (ISL) ese año.

En medio de una fuerte presión de la afición, el PSS se convirtió en equipo profesional en 2012 tras la incorporación del PT Putra Sleman Sembada, empresa que ahora gestiona el club.

Ese movimiento aseguró que PSS pudiera regresar a la máxima categoría si logran ascender.