De tamaño medio, para su género, fue descrito por primera vez como una especie separada, pero luego agrupado en otras especies de amplia distribución, hasta que fue redefinido como independiente en 2009.

O. peninsulae y otra población aislada, O. nelsoni del Islas Marías , se conservó tanto como especies separadas, al igual que O. albiventer de montano continental de México.

Los incisivos superiores están inclinados hacia adelante, con su filo de corte casi vertical.

[3]​ Morfométricamente, el cráneo del O. peninsulae es claramente distinto de otros Oryzomys mexicanos occidentales.

[17]​ Veintiún ejemplares de O. peninsulae son conocidos: seis fueron capturados en Santa Anita, Baja California en 1896 por D. Coolidge; Edward William Nelson y Edward Alphonso Goldman obtuvieron quince individuos adicionales en 1906 en San José del Cabo.

Los biólogos que trabajaban en el área en 1979 y de 1991 a 1993 no encontraron O. peninsulae, poniendo en duda su existencia.

[2]​ Es incierto cómo el Oryzomys peninsulae llegó a su localidad reciente en Baja California Sur.