Desde el año 2012 viene participando en los campeonatos de fútbol profesional organizados por la AFO y FEF, en su temporada de debut consiguió ser campeón del torneo provincial de Segunda Categoría 2012,[11] ahí en la primera fase terminó en el segundo lugar del grupo 3 y en el hexagonal final fue primero y de esa manera obtuvo su primer título en la era profesional; en la etapa zonal estuvo en la zona 3 junto con los equipos de Estudiantes, Academia Alfaro Moreno, Academia Manuel Suquilandia Sporting Club y Club Equipo de Cristo, ahí terminó en segundo lugar después de obtener 16 puntos en 8 partidos jugados, ganó 5, empató 2 y perdió 1, clasificó a la siguiente ronda entre los cuatro mejores segundos; en el hexagonal final estuvo en el grupo B con los equipos Municipal Cañar, Delfín S.C., Juventud Minera, Club Deportivo Venecia y Deportivo Coca, ahí tuvo una discreta actuación terminando en 4.º lugar con 8 puntos en 8 partidos jugados, con 2 victorias, 2 empates y 4 derrotas; así concluyó su primera temporada en la era profesional.
y Liga Deportiva Juvenil, con un gran desempeño terminó en primer lugar con 24 puntos en 10 partidos jugados con 8 victorias y 2 derrotas, esta se convertiría en la mayor cantidad de puntos en la etapa zonal para la amenaza verde; en el hexagonal semifinal tuvo una buena participación peleando por clasificar al cuadrangular final[18] hasta la última fecha, estuvieron Pelileo S.C., Gualaceo S.C., F.C.
En el 2015 consiguió su segundo título provincial[21] tras clasificar en el primer lugar del grupo 1[22] y ganar el hexagonal final del torneo provincial; en la etapa zonal compartió el grupo A de la zona 4 con Norte América, Club Social Deportivo Tecni Club, Club Deportivo Ciudadelas del Norte, Liga Deportiva Estudiantil Primero de Mayo y Club Deportivo Estudiantes del Cenepa, terminó invicto en el 2.º lugar con 22 puntos en 10 partidos jugados producto de 6 victorias y 4 empates, clasificó entre los mejores segundos; en el hexagonal semifinal estuvo en el grupo B con Pelileo S.C., Deportivo Otavalo, Guayaquil S.C., Alianza del Pailón e Club Deportivo Italia F.C., tuvo una discreta actuación finalizando en el 4.º lugar con 11 puntos en 9 partidos jugados, consiguiendo 3 victorias, 2 empates y 4 derrotas, el año 2015 terminaba de esa manera para Orense.
En la etapa zonal estuvo en la zona 6 con Guayaquil S.C., San Francisco, Club Deportivo Juvenil Sevilla y Estudiantes, por primera vez en su historia Orense no lograba avanzar el zonal,[23] terminó en tercer lugar con 15 puntos en 8 partidos jugados consiguiendo 5 victorias y 3 derrotas, el sueño de llegar a la Serie B terminaba otro año de manera temprana.
[24] Tras el fracaso de la temporada 2016 y durante cinco temporadas seguidas que Orense clasificó a los zonales de Segunda Categoría representando a la provincia de El Oro, donde sus actuaciones fueron regulares llegando hasta etapas semifinales durante los años 2012 a 2016, la temporada 2017 fue la mejor del club, en el torneo de Segunda Categoría de El Oro 2017 terminaría siendo campeón delante del Audaz Octubrino[25] y se clasificó a los zonales;[26] en la segunda fase logró obtener el primer lugar de la zona 5 y clasificarse a la tercera etapa, compartió zona con Rocafuerte F.C., Atenas F.C., Municipal Cañar y Club Social y Deportivo Búffalos,[27] finalizó con 18 puntos en 8 partidos jugados con 6 victorias, 1 empate y 1 derrota,[28] se le restó un punto por no presentar los roles de pago; ya en la tercera etapa quedó segundo del grupo 3 junto con Puerto Quito, C.S.
Patria y Duros del Balón, clasificó como mejor segundo al cuadrangular final[29] con 13 puntos en 6 partidos jugados después de obtener 4 triunfos, 1 empate y 1 derrota;[30] mientras que en la Segunda Categoría 2017 lograría ser subcampeón al empatar a cero goles en la última fecha ante el Puerto Quito, dándole su primer subcampeonato y el ansiado ascenso a la Serie B.
[31][32][33] Compartió en el cuadrangular final con Rocafuerte F.C., Chacaritas F.C., además del Puerto Quito, ascendió con 8 puntos a raíz de una victoria y cinco empates en 6 juegos disputados, tras 8 años desde su fundación el equipo bananero[34] cerraba la temporada consiguiendo su máximo objetivo, el tan anhelado ascenso a la Serie B.