Se trata de un proyecto abierto, donde los usuarios pueden trabajar en forma colaborativa, con la ventaja de obtener el modelizado y visualización de estructuras complejas, y poder emplear los datos en varios lenguajes y formatos para su reutilización.

[3]​ El programa funciona en diferentes sistemas operativos como son Windows, Linux y MacOSX.

[4]​ La idea central del programa, consiste en brindar soluciones para los diversos formatos en que se almacenan los datos moleculares en archivos que pueden ser interconvertidos con esta aplicación.

Open Babel facilita el realizar conversiones de 113 formatos diferentes.

[6]​ Si bien el software ofrece múltiples utilidades en lo relativo a la visualización y reutilización de archivos que pueden ser recuperados en varios formatos, puede además emplearse como una base de datos disponible para disciplinas como química computacional, química orgánica, y farmacología (síntesis de fármacos).