[2] La ONEM consta de dos categorías, tres niveles y cuatro fases.[3][4] La competición en todas sus fases se divide en dos categorías: Los estudiantes de ambas categorías (Alfa y Beta) se enfrentan a la misma prueba y las mismas preguntas, sin embargo, al momento de realizar la clasificación, cada estudiante compite solo con los que son de la misma categoría.[6] Las pruebas son evaluadas por un equipo calificador de acuerdo a las bases.Un puntaje igual a 0 puntos se considera descalificatorio, independientemente del orden de mérito.La premiación solo se da en la cuarta fase (final) y está a cargo del Ministerio de Educación, aquí se entregan diplomas de forma general y medallas a quienes hayan ocupado los primeros lugares.
Diploma característico otorgado a los participantes de la fase final de la ONEM.
Medallas de oro y plata otorgadas en la final de las ediciones más recientes.