Era conocida también como la primogénita debido al carácter antiguo de la ciudad.
El equipo nace en 1996 y desde ese momento dirigido por César Farías, Nueva Cádiz comenzó disputando partidos en la categoría sub-17.
En 1996 ingresa el delantero/mediocampista Juan Arango al Nueva Cádiz FC; al año siguiente se titulan campeones de la serie nacional sub-20, logrando ascender en la temporada 1997/1998 a la Segunda División de Venezuela.
En esa primera temporada en la categoría de plata del balompié venezolano, logran el ascenso a la Primera División de Venezuela al obtener el campeonato.
Debido a un convenio de Zulianos FC con Unión Atlético Maracaibo en la temporada 2002/2003 para el puesto en primera división que había ganado Zulianos, se decide otorgárselo al Unión Atlético Maracaibo quedando Zulianos Fútbol Club nuevamente en la Segunda División de Venezuela.