El juego puede ser considerado una continuación espiritual de Ninja Gaiden Sigma ya que aquel juego era también una versión mejorada del Ninja Gaiden original de Xbox.

Una versión para PlayStation Vita, titulado Ninja Gaiden Sigma 2 Plus, fue lanzado en febrero de 2013.

[1]​ Aunque Team Ninja desarrolló el juego, el creador de la franquicia Tomonobu Itagaki no dirigió el proyecto, ya que Itagaki abandonó Tecmo Koei al terminar el desarrollo de Ninja Gaiden II.

Eurogamer señaló que hay menos enemigos en pantalla a la vez en la versión de PS3.

En febrero de 2013, salió al mercado Ninja Gaiden Sigma 2 Plus para la consola PlayStation Vita.