Los equipos de los Aggies participan en las competiciones universitarias organizadas por la NCAA, y forman parte de la Conference USA.
El término Aggie que utiliza la Universidad Estatal de Nuevo México para denominar a sus deportistas es una abreviatura proveniente de la palabra Agriculture, y es común verlo utilizado en las universidades técnicas con estudios en especialidades agrónomas, como fue ésta en sus orígenes.
La mascota es Pistol Pete, un pistolero, aunque en 2005 una parte del alumnado consiguió que se cambiara la pistola por un lazo y el nombre por simplemente Pete.
Los Aggies participan en las siguientes modalidades deportivas: El mayor éxito del equipo de baloncesto masculino fue su participación en la Final Four de 1970.
Su actual entrenador es el exjugador de la NBA Reggie Theus.