[1]​[2]​ El género comprende tres especies que forman parte del grupo llamado de los antílopes enanos.

En su estudio utilizaron secuencias del citocromo b mitocondrial y mediciones lineales del cráneo para investigar más a fondo la similitud de las tres especies de Neotragus.

Sin embargo, Neotragus pygmaeus, la especie tipo —que nunca antes se incluyera en los análisis filogenéticos— no está estrechamente relacionada.

Según estos autores, podría compartir un antepasado común más reciente con otro "antílope enano", Oreotragus oreotragus, y con los duiqueros del taxón Cephalophini.

Por lo tanto, sugirieron resucitar el género Nesotragus Von Dueben, 1846 para incluir en él a Neotragus moschatus y Neotragus batesi, dejando Neotragus pygmaeus como la única especie del género.