[2]​ Neomura es un grupo muy variado, que comprende desde procariontes extremófilos hasta los eucariontes pluricelulares, pero todos ellos comparten ciertas características moleculares.

Todos tienen histonas que se utilizan como andamiaje de los cromosomas y la mayoría presentan intrones.

Si Eukarya fuese tan antiguo como Bacteria, es casi seguro que se habría ramificado durante los muchos millones de años que llevó a las bacterias evolucionar a la respiración aeróbica realizada por las mitocondrias.

[3]​[4]​ Chlorobacteria Hadobacteria Cyanobacteria Gracilicutes Eurybacteria Endobacteria Actinobacteria Archaea Eukarya Leyendas: [A] Bacteria Gram-negativa con pared de peptidoglicano y clorosomas.

[C] Revolución glicobacteriana: membrana externa con inserción de lipopolisacáridos, hopanoides, ácido diaminopimélico, ToIC y TonB.

[5]​ El árbol actualizado de Cavalier-Smith es aproximadamente el siguiente:[5]​ Chloroflexi Patescibacteria Armatimonadetes Melainabacteria Cyanobacteria Endobacteria Actinobacteria Fusobacteria Hadobacteria Aquithermota Synthermota Proteobacteria Spirochaetes Sphingobacteria (FCB) Planctobacteria (PVC) Euryarchaeota (incluye a DPANN) Crenarchaeota s.l (TACK) Lokiarchaeota Heimdallarchaeota Eukaryota Neomura no es considerado como un clado válido por la mayoría de investigadores, aunque ha encontrado apoyo en un análisis de múltiples proteínas ribosómicas en 2020.

[7]​ Actualmente la teoría más aceptada postula que el origen eucariota proviene de la fusión biológica por endosimbiosis de al menos dos organismos procariotas diferentes: una arquea y una bacteria,[8]​ el arquea del clado Asgard y la bacteria del clado Alphaproteobacteria.