[1]​ Fue escrito en 2002/2003 por el programador australiano Michael G. Zinner para su plataforma fabFORCE.net usando Delphi 7 / Kylix 3.

La primera versión previa de MySQL Workbench fue liberada en septiembre de 2005,[6]​ y no fue incluida en la MySQL GUI Tools Bundle.

[7]​ El versionado comenzó con la 5.0, para remarcar el hecho que MySQL Workbench fue desarrollado como el sucesor de DBDesigner4.

[13]​ La " Community Edition " es un producto con todas las funciones que no se paralizó de ninguna manera.

[18]​ MySQL Workbench ha sido revisado por la comunidad de código abierto y revistas impresas.