Fundado en el siglo XIII, del antiguo edificio quedan algunos vestigios y trazas de frescos.
El Convento de San Marcos fue expropiado por vez primera en 1808, en la época napoleónica; se devolvió a los frailes dominicos después de la caída del emperador francés y durante la Restauración, el monasterio fue nuevamente confiscado por el Estado italiano en 1866, por un famoso R.D.
La Sala Capitular (Sala Capitolare) fue pintada al fresco con la compleja y alegórica Crucifixión y santos (Crocifissione) terminada en 1442, una verdadera obra maestra, durante cuya realización se dice que se emocionó hasta las lágrimas el propio pintor.
Al fondo del ala sur se encuentran las celdas que habitó Savonarola.
San Marcos alberga aún una comunidad dominica, habitando los monjes el claustro interno.
M. Scudieri, The frescoes by Angelico at San Marco, Florence, Giunti, 2004