[5]​ La principal corriente es el río San Rodrigo que recorre el centro del municipio en dirección este hacia el río Bravo, saliendo del municipio con rumbo al de Jiménez, existe además el río San Antonio, que en el mismo sentido recorre la zona sur de Zaragoza y posteriormente ingresa al municipio de Piedras Negras, además de numerosas corrientes menores, todas afluentes del río Bravo.

[6]​ Todo el territorio municipal forma parte de la Región hidrológica Bravo-Conchos y se encuentra dividida en tres diferentes cuencas, la mayor parte del centro y el este del territorio forma parte de la Cuenca Río Bravo-Piedras Negras, la zona suroeste integra la Cuenca Presa Falcón-río Salado y la zona noreste forma parte de la Cuenca Río Bravo-Presa de la Amistad.

[7]​ En el municipio de Zaragoza se registran cuatro diferentes tipos de clima, el mayoritario es el Seco semicálido que se registra en las zonas central, norte, este y sur del territorio, en la zona noroeste el clima que se registra es el Muy seco semicálido y finalmente existen dos pequeñas zonas en el extremo este donde hay clima Semiseco templado y otra en la zona centro-este donde el clima es Seco muy cálido y cálido;[8]​ la temperatura media anual del territorio en su zona más occidental es de 16 a 18 °C, le sigue una zona que rodea a la anterior en que el promedio es de 18 a 20 °C y en el resto del territorio es superior a los 20 °C;[9]​ la precipitación promedio anual divide el territorio en dos zonas diferentes, una franja que va desde el noroeste hasta el sureste del municipio registra un promedio de 200 a 300 mm, y las dos zonas del suroeste y del noroeste, tiene un promedio de 300 a 400 mm.

[10]​ La flora está definida por la altitud, la gran mayoría del territorio tiene vegetación correspondiente al matorral desértico, donde las principales especies son el mezquite, huizache, nopal, gobernadora, ruda y estafiate, hacia el oeste, y en las zonas más elevadas de la Sierra del Burro, se alcanza a establecer el bosque templado, principalmente de encino;[11]​ las principales especies animales que hay en el municipio son murciélago, topo, oso, león, gato montés, lobo, coyote, zorra, tejón, ardilla, liebre, ratón, armadillo, jabalí, venado, y aves como calandria, colibrí, grulla, garza, pato, cisne y gaviota.

El Ayuntamiento entra a ejercer su cargo el día 1 de enero del año siguiente en que tuvo verificativo el proceso electoral.