Su cabecera es la población de San Pablo Etla.
San Pablo Etla se encuentra localizado en el centro del estado de Oaxaca.
El territorio municipal tiene una extensión total de 44.525 kilómetros cuadrados que equivalen al 0.05% de la extensión total del estado.
El municipio se encuentra formado por solo nueve localidades, las principales y su población de acuerdo al Censo de 2010 son: El gobierno del municipio de San Pablo Etla se rige por principio de usos y costumbres que se encuentra vigente en un total de 424 municipios del estado de Oaxaca y en las cuales la elección de autoridades se realiza mediante las tradiciones locales y sin la intervención de los partidos políticos.
El ayuntamiento de San Pablo Etla está integrado por el presidente municipal y un síndico regidor.