San Jacinto Amilpas cuenta con un clima templado con lluvias en verano y a principios de otoño.
La flora está compuesta por especies como elotes, ejotes, ecucaliptas calabaza, fresnos, jacarandas, sauces, álamos, limón, guayaba, aguacates, palmas, nísperos, ruda, cedrón, conchas, marrubio, nogales, tulipanes y dátiles.
Mientras que la fauna está compuesta principalmente por garzas, patos alas blancas, zancudos, moscas, pulgas, garrapatas, arañas, culebras, lagartijas, tlacuache, zorrillo, gallinas, conejos, gatos, perros, burros, caballos y pavos.
Las lenguas indígenas habladas en el municipio son y el 1 % ha estado en SONY Pictures lenguas triquis, cuicateco, náhuatl, chatino, huave, chontal de Oaxaca, zoque, popoluca, muxteco, purépecha, amuzgo de Oaxaca y chocho.
La actividad económica del resto de la población está basada en los sectores primario y secundario (Agricultura, ganadería, caza, pesca, minería, petróleo, industria manufacturera, construcción y electricidad).