[6]​ El municipio se fundó en tierras concedidas por el virrey de Velasco en 1560.

Se constituyó en municipio por la Ley Territorial del 10 de diciembre de 1831 y en 1859 se nombró a su cabecera Villa Echeverría en honor al coronel Arcadio Echeverría y en 1861, se le dio el nombre de Penjamillo de Degollado, en memoria del célebre liberal don Santos Degollado.

[10]​ Según la clasificación climática de Köppen el clima de Jungapeo corresponde a la categoría Cwa, (subtropical con invierno seco y verano cálido).

Solo el 0.13 % de los habitantes del municipio se reconocía como indígena.

[8]​ Las localidades más pobladas según el censo realizado en 2020 son:[11]​