El municipio de Jefferson (en inglés: Jefferson Township) es un municipio ubicado en el condado de Morgan en el estado estadounidense de Indiana.

En el año 2010 tenía una población de 3274 habitantes y una densidad poblacional de 35,5 personas por km².

[2]​ El municipio de Jefferson se encuentra ubicado en las coordenadas 39°26′16″N 86°29′23″O / 39.43778, -86.48972.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, el municipio tiene una superficie total de 92.22 km², de la cual 90,56 km² corresponden a tierra firme y (1,8 %) 1,66 km² es agua.

Del total de la población el 0,89 % eran hispanos o latinos de cualquier raza.