[2]​[14]​ Originalmente una población totonaca que posteriormente se convirtió en olmeca, y como en casi toda Mesoamérica término en siendo territorio Azteca, para la época de la colonia, aquila era apenas un barrio que pertenecía al municipio de Maltrata, para 1802 debido a una petición hecha a la Corona española Aquila pasó a ser emancipado de Maltrata.

[12]​[13]​ El gobierno del municipio está a cargo de su Ayuntamiento, que es electo mediante voto universal, directo y secreto para un periodo de tres años que no son renovables para el periodo inmediato posterior pero sí de forma no continua.

[15]​ Está integrado por el presidente municipal, un síndico único y un regidor, electo por mayoría relativa.

[17]​ Para su régimen interior, el municipio además de tener una cabecera y manzanas, se divide en rancherías y congregaciones, teniendo estas últimas como titulares a los subagentes y agentes municipales, que son electos mediante auscultación, consulta ciudadana o voto secreto en procesos organizados por el Ayuntamiento.

[18]​ En el municipio se cuenta con dos congregaciones Cumbres de Aquila y Atiopan ambas eligen sus comisarios ejidales por plebiscito.