La actual iglesia fue casi construida de nuevo entre los años 1653 y 1662.

La vida eremítica anterior (en el lugar donde se construyó el monasterio) fue probada por humanos enterrados profundamente bajo los cimientos de los edificios más antiguos de Esteban el Grande.

Putna se completó en tres años, pero se consagró solo después de un año más, dado que los moldavos participaron en otras batallas.

Durante mucho tiempo, se creyó que el sitio había sido diseñado por un arquitecto griego llamado Theodor; desde entonces, se ha demostrado que la interpretación de las crónicas de Kilia en las que se basaba esto era incorrecta.

El bordado más antiguo del monasterio, fechado a finales del siglo XIV, es un epitafio realizado con seda e hilo de oro por Euphima, una monja serbia, hija de Vojihna, junto con su hija Euprasijka.