Su nombre Al-Gafequi proviene de Gafeq, como era conocida su ciudad natal, la actual Belalcázar, en época andalusí.

[2]​ Se formó tanto en Córdoba como en Bagdad, aunque regresó a la capital cordobesa para desarrollar su trabajo.

[4]​ Al-Gafequi estudió las obras de Hipócrates, así como a los autores Hunayn ibn Ishaq, Avicena o el cordobés Albucasis.

Durante su peregrinación a La Meca, consideró que no existía un libro que almacenara todo el saber de la oftalmología, hecho que le llevó a escribir su célebre tratado Guía del oculista, cuya copia se conserva en la biblioteca del Monasterio de El Escorial y otra en El Cairo y continúa siendo analizado por los especialistas.

[2]​Esta obra estuvo dedicada a su hijo Ahmad Al-Gafeq, quien también se convirtió en un célebre botánico y farmacólogo.