En la localización del juego para el mercado americano desde la versión japonesa para FDS se llevaron a cabo algunos cambios.
Según la historia de la versión americana, una raza de alienígenas del lejano planeta Attackon situado en la galaxia Ergo han secuestrado al profesor Einstein J. Cinnamon, un brillante científico que ha inventado un edulcorante bio-nuclear.
El jugador toma el papel del piloto de la nave "Stinger", construida por el Dr. Cinnamon, para rescatar al científico.
Los protagonistas principales eran los nietos de los pilotos del primer TwinBee, mientras que el antagonista originalmente se llamaba Gattlantis, siendo el nieto de King Spice (el villano del TwinBee original).
En la versión USA, WinBee fue eliminado del juego y GwinBee ocupó su lugar como nave del jugador 2, pero si se conecta la versión japonesa a una NES americana con un adaptador de 60 a 72 pines, se puede obtener el tercer jugador usando el adaptador NES Four Score.
En la versión japonesa en cartucho se añadió un tercer nivel de dificultad más fácil que los anteriores.