Fue la cuarta Misión fundada por el fraile entre junio y septiembre de 1797.De 1821 a 1846 California formó parte del México independiente.Después de la guerra entre Estados Unidos y México la misión fue puesta en venta por el gobernador Pío Pico.Entre 1845 y 1923 fue utilizada como etapa para las diligencias de la Butterfield Stage Lines, después de lo cual fue utilizada como almacén y granja porcina.En 1923, la iglesia volvió a ser utilizada con la llegada de misioneros oblatos.
