Milton Patiño ha jugado en varios clubes del Fútbol Profesional Colombiano: Atlético Nacional, Junior, Deportes Tolima y Deportes Quindío, club que dejó a finales de 2006.
[1] En el primer semestre del 2007 jugó con el América de Cali.
[3] En enero de 2009 fue confirmada su llegada a Millonarios como tercer arquero.
[4] Un año más tarde sale del club bogotano para jugar la temporada 2010 con el Atlético Bucaramanga,[5] el 2011 en el Fortaleza F.C.
[7] Su hijo Santiago Patiño fue contratado por el Orlando City SC en enero de 2019 tras descarte en el fútbol universitario con la Universidad Internacional de Florida donde se graduó como Administrador de Instituciones Deportivas.