Milligan es una villa situada en el condado de Fillmore, Nebraska, Estados Unidos.

[2]​ La localidad está ubicada en las coordenadas 40°30′00″N 97°23′18″O / 40.50000, -97.38833 (40.499957, -97.388419).

[3]​ Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, tiene una superficie de 0.67 km², correspondientes en su totalidad a tierra firme.

[3]​ Según el censo de 2020, en ese momento había 244 personas residiendo en la localidad.

Del total de la población, el 1.23% eran hispanos o latinos de cualquier raza.