[3] Miguel Vargas realizó sus divisiones menores en la Universidad Católica, club al que llegó a los 12 años.
El 2015 fue promovido al plantel principal por Mario Salas, apareciendo en el banco de suplentes en 6 oportunidades.
Fue habitual suplente de Cristopher Toselli y del argentino Franco Costanzo.
El 2017 fue enviado a préstamo a Deportes Santa Cruz de la Segunda División de Chile,[4] donde agarraría una buena continuidad con 36 partidos jugados en la temporada.
Para el 2018 volvería a los cruzados, siendo habitual suplente de Matias Dituro.