En la temporada 1999-2000 da el salto al banquillo primer equipo coruñés en LEB Oro como parte del cuerpo técnico.

En 2011, regresa a Galicia para ser el director deportivo del Club Ourense Baloncesto durante la temporada 2011-2012.

En 2012, firma con los Malabo Kings de Guinea Ecuatorial al que dirige durante temporada y media.

En la temporada 2015-16, Miguel Ángel Hoyo vuelve a tierra gallegas para ser el entrenador del Club Xuventude Baloncesto de Vigo en LEB Plata.

[3]​ En marzo de 2017, Hoyo firma como entrenador del Club Bàsquet Menorca en Liga EBA con el que finalizó la temporada.