Las dos especies son: La diferencia entre un ratón canguro pálido y uno oscuro es el color de su pelaje, que se sugiere en sus nombres.

Tanto las especies de Microdipodops pálidos como los oscuros comparten las mismas características, como tener ojos grandes, pelaje largo y sedoso, patas delanteras cortas, patas traseras largas y una cola larga y delgada con pelo en el extremo que se usa para el equilibrio.

[1]​ Sus patas traseras son proporcionalmente grandes con pelos rígidos con flecos en los costados y la superficie inferior de sus pies para ayudarlos a moverse en hábitats desérticos arenosos.

[1]​ Debido a sus bullas timpánicas extremadamente infladas, que se extienden en la parte superior de su cabeza, y la gran estructura de la oreja, los cráneos de los ratones canguro son relativamente más grandes en tamaño que su cuerpo, lo que contribuye a su audición aguda utilizada para detectar depredadores.

[2]​ Tanto los ratones canguro oscuros como los pálidos son herbívoros, principalmente granívoros.