La especie tipo fue descrita por Bohlin en 1953, a partir de fósiles que se han encontrado en lugares como Mongolia Interior y Gansu, China, bajo el nombre Microceratops gobiensis, pero el nombre genérico había sido utilizado ya en la designación de un insecto, una avispa ichneumon de la subfamilia Gelinae.
Una segunda especie, M, sulcidens, Bohlin, 1953, es considerada sinónimo de M. gobiensis.
Fue uno de los primeros ceratopsianos, o dinosaurios con cuernos, junto con Psittacosaurus en Mongolia.
Microceratus pertenecía a Ceratopsia, un grupo de dinosaurios herbívoros con picos similares a loros que prosperaron en América del Norte y Asia durante el período Cretácico, que terminó hace aproximadamente 66 millones de años.
Durante el Cretácico, las plantas con flores estaban "geográficamente limitadas en el paisaje", por lo que es probable que este dinosaurio se alimentara de las plantas predominantes de la época, helechos, cícadas y coníferas.