Después de graduarse en la educación secundaria, estudió la carrera de Medicina en la Université Paris-Est Créteil (UPEC), situada en Créteil, donde se licenció en 1978.

Después obtuvo el Doctorado en Medicina y se diplomó en Bioética, llegando a enseñar esta materia en el Hospital Henri Mondor de Créteil.

Tomó posesión del cargo un mes más tarde, en una ceremonia celebrada en la Catedral de Santa Genoveva y San Mauricio de Nanterre.

El semanario también evoca una posible relación íntima que Michel Aupetit habría tenido con una mujer en 2012.

El 25 de noviembre presentó su renuncia en una carta enviada al Papa Francisco.