Este mutante, considerado como reina, una vez habiendo obtenido suficiente energía empieza a mudarse la piel.
[5] En cuanto emergió del agua empezó inmediatamente destruir los edificios de Tokio con sus olas sónicas creadas gracias a sus enormes alas.
[5] Días más tarde, el Megaguirus regresó a Tokio para perseguir al Godzilla.
Godzilla logra librarse de las garras del Megaguirus y empieza a inhalar el aire para soltar luego su aliento atómico, no obstante el Megaguirus es más rápido y pincha al Godzilla con su aguijón y empieza a absorber la energía, aumentando su poder e impidiendo al Godzilla utilizar el suyo.
Poco después, Megaguirus utiliza la energía absorbida para lanzar un ataque atómico contra Godzilla y consigue arrebatarlo.
Para asegurar la victoria, Godzilla muerde otra vez a Megaguirus y hace explotar una bola de fuego contra él.