En sus últimos meses en el Alumni fue usado como volante mixto con labores más defensivas que antes.
Luego de su buen rendimiento en junio del 2012 el Alumni y el Olympiakos Volou acordaron el traspaso de Matías Bolatti por 4 años al club qriego que para ese entonces jugaba en segunda división.
Durante su primera temporada jugó 33 partidos (30 por liga y 3 por la copa griega) marcando 1 gol (por liga) y siendo figura del Olympiakos Volou.
Con la salida de Miguel Ángel López, y la llegada de Julio Comesaña a la dirección técnica del Junior, Bolatti empieza a ser tenido en cuenta como titular y no como revulsivo.
En su primer partido como titular jugó 64 minutos en la victoria 1 a 0 del Junior frente al Envigado siendo alineado como mediocampista de creación y no de primera línea.