El Mutua Madrid Open 2016 fue un torneo de tenis ATP World Tour Masters 1000 en su rama masculina y WTA Premier Mandatory en la femenina.
Los cabezas de serie se establecieron con arreglo al ranking del 25 de abril.
* Stanislas Wawrinka habría sido el cabeza de serie n.º 3 si Roger Federer se hubiera retirado del torneo días antes del sorteo del cuadro Masculino; por eso conservó el n.º 4.
** Como los 8 primeros cabezas de serie tenían una exención (bye en inglés) que les permitió comenzar el torneo en segunda ronda, en aplicación de las normas ATP quienes perdieran su primer partido sumarían los puntos correspondientes a los que jugaron y perdieron en primera ronda.
Novak Djokovic venció a Andy Murray por 6-2, 3-6, 6-3 Simona Halep venció a Dominika Cibulkova por 6-2, 6-4 Jean-Julien Rojer / Horia Tecău vencieron a Rohan Bopanna / Florin Mergea por 6-4, 7-6 (5) Caroline Garcia / Kristina Mladenovic vencieron a Martina Hingis / Sania Mirza por 6-4, 6-4