Sweeney trabajó con Lynch en diversas películas y series de televisión, más notablemente en la serie original de Twin Peaks (1990), Lost Highway (1997), The Straight Story (1999) y Mulholland Drive (2001).
Sus créditos como editora incluyen Blue Velvet (1986), Wild at Heart (1990), Twin Peaks (1991), Industrial Symphony (1991), Twin Peaks: Fire Walk With Me (1992), On the Air (1992), Hotel Room (1993), Lost Highway (1996), The Straight Story (2000), Mulholland Drive (2001) and Baraboo (2009).
Desarrolló, prudujo, escribió y montó The Straight Story, por la cual Richard Farnsworth obtuvo una nominación al Premio de la Academia.
Ella escribió, dirigió, produjo y montó una película corta y muda, titulada In the Eye Abides the Heart, fue filmada en Buenos Aires, se presentó en el Festival Internacional de Cine de Venecia en el 2006.
También es miembro del AMPAS, BAFTA, el DGA, y el WGA (donde es parte Comité de Escritores Independientes).