Marlborough se encuentra ubicado en las coordenadas 41°37′55″N 73°59′3″O / 41.63194, -73.98417.

Según la Oficina del Censo, la ciudad tiene un área total de 68,6 km² (26,5 mi²), de la cual 64,3 km² (24,8 mi²) es tierra y 4,3 km² (1,7 mi²) (6.30%) es agua.

Según la Oficina del Censo en 2000 los ingresos medios por hogar en la localidad eran de $49,788, y los ingresos medios por familia eran $56,933.

Los hombres tenían unos ingresos medios de $38,074 frente a los $29,608 para las mujeres.

La renta per cápita para la localidad era de $21,079.