Pilati nació en Nápoles, y su talento musical natural se mostró cuando era muy joven.

En 1925, por consejo de Ildebrando Pizzetti, fue a Milán, donde trabajó como profesor, crítico de música y arreglista de partituras vocales para Casa Ricordi[1]​ hasta 1930, cuando se volvió a Nápoles para ejercer la profesión en el conservatorio donde había estado estudiando.

En 1933 aceptó un puesto en el conservatorio de Palermo, donde entre sus alumnos tuvo a Giuseppe Ruis, volviendo a Nápoles en 1938, donde enfermó y murió justo antes del estallido de la Segunda Guerra Mundial.

A su muerte, trabajaba en una ópera, Piedigrotta, con un libreto en dialecto napolitano.

Su obra continuó siendo popular durante un cierto tiempo después de su muerte, pero se redujo gradualmente hasta su redescubrimiento en la década de 1950, cuando se publicó por primera vez su Sonata para flauta y pianoforte.