Ha sido en dos ocasiones diputado federal y presidente municipal de Querétaro.

Marcos Aguilar Vega es licenciado en Derecho y maestro en Derecho Constitucional y Amparo por la Universidad Autónoma de Querétaro, institución en la que también se desempeñó como docente.

Permaneció en el mismo hasta el 2 de abril de 2018 en que se separó del mismo por licencia temporal para integrarse a la campaña electoral como candidato a diputado plurinominal.

[1]​ Una vez realizado en el proceso electoral en que la que fue elegido, regresó a la presidencia municipal el 2 de julio y se separó definitivamente del cargo el 27 de agosto.

[2]​ Asumió como diputado plurinominal a la LXIV Legislatura el 1 de septiembre.