Sus inicios profesionales fueron en Club Ferro Carril Oeste, en la liga nacional de su país.También se destacó en la NBA y en la liga española de baloncesto.En 2002, fue seleccionado en la segunda ronda del draft de la NBA con el número 56 por los San Antonio Spurs.El 27 de julio de 2013, los Indiana Pacers anunciaron que en una transacción con los Phoenix Suns habían adquirido a Scola a cambio del alero Gerald Green, el pívot Miles Plumlee y un futuro pick en la primera ronda del draft.En el partido en donde Argentina derrotó a Nigeria 94-81 (válido por la 2.ª fecha del Mundial de China 2019) el argentino anotó 23 puntos, lo cual le permitió superar al australiano Andrew Gaze en el segundo lugar.Debutó en pretemporada con derrota ante New Orleans Hornets, jugando 23 minutos, anotando 8 puntos y capturando 7 rebotes.Jugó su primer partido ante su nuevo público en pretemporada, el 11 de octubre, con victoria ante el equipo griego Panathinaikos BC, encestando 17 puntos y capturando 6 rebotes en 26 minutos.El 27 de julio de 2013 los Indiana Pacers anunciaron que en una transacción con los Phoenix Suns habían adquirido a Scola a cambio del alero Gerald Green, el pívot Miles Plumlee y una futura elección en la primera ronda del Draft.El presidente de los Pacers, Larry Bird, indicó que Scola aporta mucha experiencia al banquillo del conjunto: "Tiene experiencia en la NBA, a nivel internacional y es el tipo de jugador que encajará bien en nuestro equipo."[cita requerida] En julio de 2017 y tras diez años en la NBA, decide dejar la liga estadounidense y enrolarse en las filas del Shanxi Zhongyu de la liga china.[9] Tras una temporada en el Shanxi Zhongyu, en agosto de 2018 ficha por Shanghai Sharks.En 2012 formó parte del plantel que obtuvo el cuarto puesto en los Juegos Olímpicos de Londres.En 2013 formó parte del plantel que participó en el Campeonato FIBA Américas y obtuvo la medalla de bronce, logrando también la clasificación a la Copa Mundial del año siguiente.En 2015 fue parte del equipo que compitió en el Campeonato FIBA Américas disputado en Ciudad de México, obteniendo la clasificación a los Juegos Olímpicos de 2016 y el segundo puesto en este torneo.
Scola es ovacionado en su último partido con la Selección, en los JJOO de Tokio.