Para el Apertura 2007 es adquirido por el entonces campeón del fútbol mexicano, Pachuca, junto con Rafael Márquez Lugo, en una transacción a cambio de Luis Ángel Landín.

Anotó tan solo 5 goles con la camiseta Hidalguense, quedando por debajo de las expectativas con las que fue fichado.

Es acompañado por segunda ocasión por Rafael Márquez Lugo, atacante mexicano con quién había formado una interesante dupla en Pachuca que no llegó a explotar.

Luis Gabriel dejó por segunda vez al Atlante, anotando 53 goles para el equipo en sus dos etapas como Potro.

En plena pretemporada con los michoacanos en Zihuatanejo, Guerrero se lesiona y eso le evitaría empezar la liga.

Reapareció hasta la fecha 6 contra el Atlas y marcó sus primeros goles en su segunda etapa con Morelia al equipo de Tigres.

El día primero de noviembre del 2009 marcaría el que consideró el "mejor gol en su carrera" ante Guadalajara en el Estadio Morelos tras un servicio desde la izquierda de Jaime Durán, que prendió con una gran chilena ante la mirada del arquero Luis Ernesto Michel.

Jugando como segunda punta, fue fundamental en el funcionamiento del cuadro de la selva, donde se reencontró con el entrenador José Guadalupe Cruz, quien ya lo había dirigido en Atlante.