A fines del siglo XIX, los colonos utilizaron la tierra para la ganadería.
El área se utilizó para enseñar a los jóvenes la ganadería básica y otras habilidades de supervivencia al aire libre.
En 1943, durante la Segunda Guerra Mundial, el Departamento de Guerra de los Estados Unidos ejerció un dominio eminente sobre la Escuela Ranch y todas las propiedades restantes en el área para que la ubicación relativamente aislada pudiera usarse para el Proyecto Manhattan secreto, que finalmente desarrolló la primera planta nuclear del mundo de las armas.
La ubicación específica del proyecto y de todos sus residentes también se ocultó al designar su dirección postal como PO Box 1663, Santa Fe, NM.
El laboratorio se fundó durante la Segunda Guerra Mundial como una instalación secreta y centralizada para coordinar el desarrollo científico del Proyecto Manhattan, el proyecto Aliado para conseguir las primeras armas nucleares.