Aunque recuperó la categoría al año siguiente, la perdió de nuevo en 1956-57 y no regresó nunca más a la élite.

Cuando Croacia proclamó su independencia, el Lokomotiva ingresó en la Treća HNL (tercera división) del sistema de ligas croata.

Sus actuaciones no fueron mucho mejor que en los últimos años y a pesar de dos presencias en la segunda categoría entre 1996 y 1998, el club no pasó de tercera en posteriores ocasiones e incluso tocó fondo en el año 2005-06 con un descenso a cuarta división.

Para encuentros con un aforo inferior, el Lokomotiva utiliza el estadio Kranjčevićeva, ubicado al oeste de la ciudad.

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