La Liga de Fútbol del Neuquén está afiliada y participa en torneos de selecciones organizados por el Consejo Federal del Fútbol Argentino (CFFA), que es un órgano interno de la Asociación del Fútbol Argentino.
Por su parte, los dos mejores equipos de la tabla general de la Categoría B ascienden a la Liga Oficial A.
La tabla general es la suma de los puntos obtenidos de todas las divisiones, primera, reserva, quinta, sexta, séptima, octava, novena y décima de cada equipo, tanto para la categoría A como para la B.
El Campeón de la Primera División de la Liga Oficial A se ganan un cupo a participar en el Torneo Regional Federal Amateur, que es la Cuarta categoría del fútbol argentino.
Desde 2013 se disputa la Copa Neuquén, una competencia de eliminación directa a partido único.