Conociéndose los lineamientos o generalidades que regirán a la Liga 2 2024, el torneo se juega por zonas según la distribución geográfica de los equipos.

Cada grupo tiene a nueve equipos, los cuales están divididos en Zona Norte y Zona Sur, donde jugarán todos contra todos en dos ruedas (ida y vuelta) en un total de 18 fechas,[1]​ esta clasificación se hizo con la intención de que los gastos logísticos se reduzcan para los clubes, quienes tendrán que asumir con la totalidad de estos egresos.

En un inicio se consideró la participación de Juan Aurich[n. 1]​ y Unión Huaral[n. 2]​.

Por otro lado, los equipos restantes conformarán un grupo para definir el descenso Actualizado a los partidos jugados el 28 de septiembre.

Si la igualdad persiste, se aplicará el Fair Play, y como último recurso, un sorteo organizado por la Liga de Fútbol Profesional.

Estas llaves se definieron en un partido único, donde el equipo mejor posicionado en la tabla fue el local.

En esta fase, el equipo mejor posicionado en la tabla fue local en el partido de vuelta.