Se asoció con Johannes Andreas Brinkman, con el que formó un estudio activo entre 1925 y 1936, a veces en colaboración con Willem van Tijen.

En 1925 se asoció con Johannes Andreas Brinkman, que había heredado un estudio arquitectónico de su padre, Michiel Brinkman.

[1]​ La obra principal de Brinkman y Van der Vlugt fue la fábrica Van Nelle de tabaco, té y café en Róterdam (1926-1929), proyectada con una forma abierta que permite la agregación de sucesivos anexos, con un diseño preciso pero humano, acogedor, algo inusual en construcciones industriales.

Otra obra emblemática suya fue el estadio Feyenoord en Róterdam-Sur (1935-1936).

También diseñaron una cabina telefónica (1931) que con el tiempo se ha convertido en un elemento icónico del paisaje urbano neerlandés.