Se compone de dos ecológicamente diferentes pequeñas lagunas (Laguna Azul y Laguna Verde) conectadas entre sí por un paso estrecho (y cruzado por un puente), que se encuentra dentro de un volcán inactivo en el tercio occidental de la isla de San Miguel.

[2]​ La laguna está clasificada como Paisaje Protegido, por decreto del Gobierno regional.

En general, las formaciones con las buenas características hidrodinámicas son las zonas con flujos de lava, piroclastos basálticos y/o de piedra pómez, condicionado por las altas temperaturas, se han producido condiciones impermeables.

Aunque a nivel hidrológico, la Laguna de las Siete Ciudades es un lago (que sólo es dividido por un puente), la mayoría de la gente se refiere a ella en términos de dos órganos separados: Lagoa Verde y Lagoa Azul.

Literalmente, la Laguna Verde y la Laguna Azul (respectivamente), que se denominan así por el reflejo del pigmento de los cuerpos: cada lado del lago refleja la luz del sol en diferentes colores.