El lago se encuentra en el suroeste, en dirección hacia el noreste, más o menos a 17 km del centro de un antiguo valle glaciar.
Se encuentra a unos cien kilómetros al sur del lago Fontana, a 23 kilómetros al este de la frontera con Chile.
El extremo occidental de la Ruta 55 se encuentra en la frontera con Chile en el Paso Huemules.
Excepto en la parte occidental andina, la cuenca del Lago Blanco no se beneficia de las precipitaciones y la evaporación es intensa.
Durante los años húmedos, el agua fluye a través del desbordamiento de su emisario situado en su extremo nordeste, y se alimenta de una gran laguna salobre intermitente (la laguna Quilchamal).